Od pierwszego stycznia 2011 roku usługi medyczne, które nie będą służyć profilaktyce, zachowaniu, przywracaniu i ratowaniu życia oraz poprawie zdrowia będą musiały zostać opodatkowane podatkiem Vat.

Ustawodawca nie wymienia konkretnie, które z usług medycznych nie będą służyć profilaktyce, zachowaniu, ratowaniu, przywracaniu i poprawie zdrowia. Usługi tego typu nie zostały również wymienione w klasyfikacji PKWiU. Tak więc to Podatnik będzie musiał samodzielnie ocenić wykonaną usługę i zdecydować, czy należy ją opodatkować podatkiem VAT czy nie.

Na 2011 rok został ustalony limit sprzedaży 150.000 zł dla zwolnienia z konieczności rejestracji do celów VAT (do wartości sprzedaży nie wliczamy kwoty podatku). Oznacza to, że w przypadku świadczenia "innych usług medycznych" oraz szkoleniowych, dopiero po przekroczeniu 150.000 zł sprzedaży tych usług, Podatnik będzie musiał zarejestrować się do celów VAT . Obowiązek podatkowy powstaje z momentem przekroczenia tej kwoty, a opodatkowaniu podlega nadwyżka sprzedaży ponad tą kwotę.

Dla sprzedaży innych usług medycznych i szkoleniowych (również opodatkowanych 23% stawką podatku) , której dotyczy limit 150.000 zł należy prowadzić ewidencję sprzedaży za dany dzień (art. 109 ust. 1 ustawy o Vat), nie później jednak niż przed dokonaniem sprzedaży w dniu następnym.

Ponieważ obowiązek opodatkowania sprzedaży usług powstaje w momencie przekroczenia limitu 150.000 zł (nie w następnym dniu po przekroczeniu, czy w następnym miesiącu), to bezpiecznym rozwiązaniem będzie dobrowolne zarejestrowanie się do podatku VAT od pierwszego dnia miesiąca, w którym przewidujemy ewentualne przekroczenie kwoty 150.000 zł.

Po dokonaniu rejestracji do celów VAT:

- Usługi medyczne, które nie będą służyć profilaktyce, zachowaniu, ratowaniu, przywracaniu i poprawie zdrowia będą opodatkowane w stawce 23% ,
- usługi szkoleniowe będą opodatkowane w stawce 23%,
- wystawiane będą faktury VAT a nie jak do tej pory rachunki. Obowiązek wystawiania faktur istnieje tylko dla klientów prowadzących działalność gospodarczą, a dla osób fizycznych nieprowadzących działalności, tylko na ich życzenie.